濒危植物宽叶羌活天然居群cpDNA非编码区多态性分析.pdfVIP

西北植物学报 ，2Ol3，33(8)：1535—1543 ActaBot．Borea1．-Occident．Sin． 文章编号 ：1000—4025(2013)08—153509 濒危植物宽叶羌活天然居群 cpDNA 非编码 区多态性分析 杨路存 ，周国英 ，聂学敏。 (1中国科学院西北高原生物研究所，西宁 810008；2青海省生态环境遥感监测 中心，西宁 810000) 摘 要 ：采用叶绿体 DNA非编码 区直接测序 的方法 ，对青海 、甘肃、四川I3个省区内濒危植物宽叶羌活 14个天然 居群的遗传多样性和遗传结构进行了研究，以明确其遗传背景，为宽叶羌活的保护提供理论依据。结果表明：(1) 14个居群 138个个体 的序列长度介于 509～515bp；碱基组成 A+T含量较高(平均 67．6 )。(2)根据序列的核苷 酸变异共鉴定出31个单倍型，其 中9种单倍型(H5、H1、H9、H10、H16、H17、H19、H20、H22)为居群所共享 ，而且 单倍型 H5分布最广、在 1o个群体的67个个体中检测到，占总样 品数的48．56 。(3)14个居群宽叶羌活具有高 水平单倍型多样性 (Hd=0．7503)和较高水平核苷酸多样性 (P．_0．00711)，但 31个单倍型没有按地理分布形成 明显的族群 ，各地理单元 中的单倍型相互混杂 ，没有明显的地理分化模式 。(4)AMOVA分析、居群 间分化度 (F。 一0．6024)分析和基 因流 (N 一0．330)分析 的结果一致 ，表 明宽叶羌活大部分遗传变异 (60．24 )发生在居群 间， 居群 间的基 因流较低 ，群体 间变异是宽叶羌活的主要变异来源 。(5)14个居群 的遗传距离在 0．000～0．007，平均 为 0．003，表 明居群间的亲缘关系较远 ，且居群间的遗传距离与地理距离之间无显著相关关系(P一0．143)，说 明宽 叶羌活居群遗传变异的分布没有 明显的地理趋势 。研究认为 ，宽叶羌活居群 间高的遗传变异可能是 由基 因流受 阻、遗传漂变、地理隔离造成 的，并提出了对该物种遗传多样性的保护策略。 关键词 ：宽叶羌活；cpDNAtrnS-trnG；遗传多样性 ；遗传结构 ；居群 中图分类号：Q346 ．5 文献标志码 ：A GeneticDiversityoftheEndangeredandEndemicSpecies，Notopterygium forbesii，BasedoncpDNAtrnSt‘rnGNoncodingSequences YANG Lucun ，ZHOU Guoying“，NIE Xuemin (1NorthwestInstituteofPlateauBiology，ChineseAcademyofSciences，Xining810008，China；2QinghaiEcosystem Remote SensingMonitoringCenter，Xining810000，China) Abstract：InordertomakeclearthegeneticbackgroundofNotopterygiumforbesii，andprovidetheoretical basisforitsprotection。weassessedthegeneticdiversityandgeneticstructureof138individualsfrom 14 naturalpopulationsofN．forbesii，anendangeredandendemicspeciesinQinghai，GansuandSichuan，using cpDNA trnS—trnG noncodingsequences．Theresultsshowedthat：(1)Sequencelengthvariedfrom 509bpto 5l5bDandbasecompositionwaswithhighA+T contentof67．6％；(2)31haplotypeswereidentifiedbased onnucleotidevariation．Amongthem，ni