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中南大学高性能计算集群
应用培训
陈伟 chenwei@
曙光信息产业(北京)有限公司
技术支持中心
CLI登录
Hostname:
Username:
test
请登录,查看说明,下载软件
文件传输
登录地址与用户
等与CLI登录相同
与FTP的区别:
security FTP
使用端口22
应用实例
上传cas文件
上传dat文件
编辑软件脚本文件 vi fl5l1.jou
file/read-case-data ../fl5l1.cas.gz
solve/iterate 10
parallel/timer/reset
solve/iterate 25
parallel/timer/usage
yes
exit
yes
exit
脚本学习方法:
file/write/start journal,指定脚本文件名1.jou
file/write/stop journal,将全部操作写入到1.jou
编辑PBS作业脚本 vi fl5l1.pbs
#!/bin/bash
#PBS -N fluent_16cpu
#PBS -l nodes=2:ppn=8
#PBS -j oe
NPROCS=`wc -l $PBS_NODEFILE`
cd $PBS_O_WORKDIR
fluent 3d -t$NPROCS -cnf=$PBS_NODEFILE -g -i fl5l1.jou fluent_16cpu.out
作业提交:
qsub fl5l1.pbs
作业状态查看:
qstat -f
算例输出
tail -f fluent_16cpu.out
图形窗口:
打开vncserver
test@node64:~ vncserver
New X desktop is node64:6
Starting applications specified in /public/home/ceshi/test/.vnc/xstartup
Log file is /public/home/ceshi/test/.vnc/node64:6.log
test@node64:~
窗口操作:与windows下操作完全一致
查看结果文件
(文本)
ansys应用
命令行方式
ansys110
图形方式
launcher110
ansys:
准备输入文件:
DB文件
resume,input,db,,,
/solu
SOLVE
apdl文件
/PREP7
K,1,0,0,0,
K,2,2,0,0,
K,3,2.3,0.2,0,
K,4,1.9,0.45,0,
K,5,1,0.25,0,
LSTR, 1, 2
LSTR, 5, 1
FLST,3,4,3
FITEM,3,2
FITEM,3,3
FITEM,3,4
FITEM,3,5
BSPLIN, ,P51X, , , , ,-1,0,0,-1,-0.25,0,
FLST,2,3,4
FITEM,2,1
FITEM,2,3
FITEM,2,2
apdl文件来源:ansys命令行窗口
pbs提交文件
#!/bin/bash
#PBS -N ansys_test
#PBS -l nodes=1:ppn=8
#PBS -j oe
cd $PBS_O_WORKDIR
rm host.list -rf
for node in `cat $PBS_NODEFILE`
do
echo -e MPI_REMSH=/usr/bin/rsh -h $node -np 1 ansysdis110 -dis -mpi HPMPI
done host.list
ansys110 -dis -mpifile ./host.list -i ansys_test.inp -o ansys_test.out
作业提交
qsub ansys.pbs
作业状态
qstat
qstat -f 996
作业输出与算例输出
file.db
ansys_test.o996
ansys_test.out
错误处理
1、文件格式的问题
2、计算节点状态
3、license
4、请求资源
接下来培训内容:
Linux操作系统初级培训
Linux环境下程序开发基础
作业管理系统(PBS)
CAE-CFD应用与解决方案
CAE-CFD应用高性能集群实例分析
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