基于生物信息学方法探析补肺益肾方的分子网络及生物功能＊.pdfVIP

世界科学技术—中医药现代化★思路与方法 基于生物信息学方法探析补肺益肾方的分子网络 及生物功能＊ 1 2 ，3 1 1 1 4 2 ，3 ＊＊ 1 李　立 ，冯素香 ，白菁安 ，姜　淼 ，吕　诚 ，郭洪涛 ，李建生 ，吕爱平 （1. 中国中医科学院中医临床基础医学研究所　北京　100700；2. 河南中医学院老年医学 研究所　郑州　450046；3. 呼吸疾病诊疗与新药研发河南省协同创新中心　郑州　450046； 4. 河南中医学院第一附属医院　郑州　450000） 摘　要 ：目的：通过生物信息学方法探析治疗慢性阻塞性肺疾病（COPD ）有效方剂补肺益肾方的分子 网络及生物功能，为中药复方药理机制研究提供新思路。方法：通过在线数据库查找补肺益肾方中药成 分的化合物，在PubChem 数据库中检索这些化合物的靶蛋白，运用Ingenuity Pathway Analysis （IPA ）软 件对二者进行分子网络、生物功能及相关生物学通路的构图和解析。结果：查找到补肺益肾方的靶蛋白 共239 个，可构建成9 个分子网络，其中最相关的前3 个分子网络功能为：Cellular Development 、Energy Production 和Cancer 。与补肺益肾方最相关的前3 个生物功能为：Cellular Growth and Proliferation 、Cell Death and Survival 和Inflammatory Response 。与补肺益肾方最相关的前3 个生物学通路为：Cell Cycle ：G1/ S Checkpoint Regulation 、Chronic Myeloid Leukemia Signaling 、Cyclins and Cell Cycle Regulation 。结论：通 过查找中药化合物靶标并通过IPA 软件进行分析的生物信息学方法可以用于解析补肺益肾方的分子网络 及生物功能。 关键词 ：补肺益肾方　靶蛋白　IPA　PubChem doi:10.11842/wst.2015.04.004　　中图分类号：R285.5　　文献标识码：A 中药复方是中医临床用药的主要形式，是中医 肺 疾 病（Chronic Obstructive Pulmonary Disease， 整体观和辨证论治思想的集中体现。与西药相比， COPD）的中药复方补肺益肾方为例，通过生物信 中医在治疗复杂慢性疾病及毒副作用小等方面具 息学方法，探析其分子网络、生物功能及作用的生 有优势，但是中药复方存在组分复杂、靶点和机制 物 学 通 路，从 而 为 中 药 复 方 药 理 机 制 研 究 提 供 新 不清的问题，因此，在现代生物科学背景下阐明中 思路。 药复方的药理机制仍是一个巨大的挑战。将网络 1　材料与方法 生物学的思想和方法应用于中药复方药理学研究， 成为一种新的趋势。本研究尝试以治疗慢性阻性 . 　中药化合物及靶蛋白的检索 1 1 补肺益肾方来源于河南中医学院李建生教授 　　　收稿日期：2014-07-21 　　　修回日期：2014-08-18 ＊　　 2009 年中医药行业科研专项（200907001-4) ：中医药防治甲型H1N1 流感、手足口病、流行性乙型脑炎诊疗机制的研究，负责人：吕爱平；国家 自然科学基金委重点项目）：调补肺肾三法调控多维分子网络治