非小细胞肺癌中tgfbr1等位基因特异性表达ase及其与单倍型关系的研究遗传学专业论文.docxVIP

非小细胞肺癌中TGFBRI等位基因特异性表达(ASE)及其与单倍型与关系的研究 非小细胞肺癌中TGFBRI等位基因特异性表达(ASE)及其与单倍型与关系的研究 中文摘要 中文摘要 非小细胞肺癌(NSCLC)约占全部肺癌的85％，转化生长因子13(TGF．13)的表 达下降在肺癌细胞中十分普遍。转化生长因子B受体I(TGFBRl)持续的表达下调， 可能导致肿瘤对TGF．p的耐受，这已经成为一种新型的肿瘤表现型。然而，NSCLC 中精确的遗传学／表观遗传学机制还不清楚。本研究中，我们选取位于TGFBR!基 因的3’非翻译区(3’UTR)的两个SNPs，采用SNaPshot定量的方法来测定等位基 因特异性表达(allelic．specific expression，ASE)情况。之后，再选取7个标签SNPs (tagging SNPs，tSNPs)来确定TGFBRl ASE样本与tSNPs构建的单倍型之间是否 存在相互关系。最后，我们发现在NSCLC样本中21．1％的个体存在TGFBRI ASE。 位于5’非编码区的rs7040869发现与TGFBRJ ASE相关(P=0．03)。rs7040869和 rs4743325是TGFBRl上连锁不平衡的两SNPs，其构建的两位点单倍型AT与 TGFBRl ASE的样本显著相关(P=-0．01)。我们的研究揭示了在NSCLC患者人群 中存在较高的TGFBRl ASE，且与TGFBRl基因的一个两位点单倍型相关。我们 的研究表明TGFBRl基因与NSCLC的病因学有着重要联系，但该作用还亟需更多 种系水平和更大样本量的实验进行验证。 关键词：NSCLC，TGFBRl，ASE，单倍型，SNP 作 者：孙金霞 指导老师：张洪涛 英文摘要 英文摘要 非小细胞肺癌中TGFBRl等位基因特是挂塞鲨坠璺垦!壁基墨璺堡翌墨苤墨笪堡壅 A haplotype of TGFBRI is predominantly found in non-small-·cell lung cancer patients displaying TGFBRl allelic--specific expression Abstract Non-small·cell lung cancer(NSCLC)accounts for approximately 85％of ml cases of lung cancer and TGF．p refractoriness iS very coml：non in NSCLC cells． Constitutively decreased TGFBRl expression，probably leading to TGF-[，resistance in tumor,is emerging as a novel tumor-predisposing phenotype．However，the precise genetic／cpigenetic mechanisms underlying the role of TGFBRl in NSCLC carcinogenesis were still largely unknown．In the present study，we first performed SNaPshot method to quantify allelic-specific expression(ASE)of two chosen SNPs that located in the 3’untranslated region(3’UTR)of the TGFBRl gene．Then，we selected seven tagging SNPs(tSNPs)of TGFBRl to assess the relationship between ASE of TGFBRl and tSNPs．reconstructed haplotypes in NSCLC tumors．As a result，ASE of TGFBRl was行equemly detected in 2 1．1％of NSCLC tumors．One tagging SNP (rs7040869)of TGFBRl in the 5’flanking region was found to significantly associate 谢t11 TGFBRl ASE in NSCLC tumoP3(P=0．03)．A 2一tSNP AT haplotype reconstructed with tSNP rs7040869 and rs4743325。in li