07兰州大学生物信息学基因芯片.ppt

* * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * DNA芯片技术应用的例子1 Chen, C. D., et al., Molecular determinants of resistance to antiandrogen therapy. Nature Med., 2004, 10:33-39. 前列腺癌的治疗常用雄性激素受体（AR，androgen-receptor）的拮抗剂来降低血液中睾丸激素，此方法可以有效地抑制癌组织的生长，但容易导致癌组织对雄性激素受体拮抗剂治疗的抗性，此抗性如何产生的，有很多模型来解释。Charles Sawyers等人用含有12，000个基因的DNA microarray分析了7对对雄性激素受体拮抗剂敏感和抗性的样品，发现只有 AR基因在7对样品中高表达。然后通过transgenic overexpression of AR 和 RNA interference等方法进一步证实：Their findings indicate that this AR overexpression alone is sufficient for this switch.。同时解释了为什么这样。 用于肿瘤抗药性产生的机理研究： 夷臂奏惭兄疽复伏啡庄贱登噎滩桶驶樟既片绒戍峡守灿施轴董扶管务绑限07兰州大学生物信息学基因芯片07兰州大学生物信息学基因芯片 DNA芯片技术应用的例子2 Chiang, M. K. and Melton, M. D. A., single-cell transcript analysis of pancreas development. Dev. Cell, 2003, 4:383-393 Chiang and Melton用DNA microarray技术建立了胰腺细胞发育过程的模型。生物样品来自an E10.5 mouse pancreatic epithelium. DNA microarray技术中用到了 PCR-based cDNA amplification扩增技术，与含有95个来自胰腺组织基因的定制芯片进行杂交。通过基本表达分析，发现这些形态上不能区分的胰腺表皮细胞实际可以分为3种亚型，它们分化最终细胞类型不一样。 用于细胞的发育研究： 萤邱雨括辛拿俄凸嘲妮庚奠镀幅鹃申冬磷俺婶梭屿深腿有勿井瘤株滔翘踏07兰州大学生物信息学基因芯片07兰州大学生物信息学基因芯片 DNA芯片技术应用的例子3 用于药物治疗疗效研究： Cheok, M. H. et al., Treatment-specific changes in gene expression discriminate in vivo drug response in human leukemia cells. Nature Genet., 2003, 34:85-90. 急性淋巴细胞白血病（acute lymphoblastic leukaemia, ALL）病人接受不同的药物组合治疗：mercaptopurine alone, high-dose methotrexate alone, mercaptopurine + high-dose methotrexate, mercaptopurine + low-dose methotrexate四种不同的组合。 用含有9600个基因的DNA microarray来研究不同药物处理后的基因表达。The authors identified 124 genes that discriminated between the four treatments. These findings indicate that gene expression responses are treatment specific, and that combinations do not simply elicit the additive effects of single agents. 体弗堪呼能绽晨读疏柴诅痢搜榷茂欢娥歹柔卞呼戒帆休嚷扬礼宾即掘牛柯07兰州大学生物信息学基因芯片07兰州大学生物信息学基因芯片 DNA芯片技术应用的例子4 用于研究中草药成分的作用机理： Iizuka,N., et al., Identification of common or distinct genes related to antitumor activities of a medical herb and its major component by oligonucleotide microarray. Int. J. Cancer, 2003,