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药物设计中3D-QSAR应用,为计算机辅助药物设计基础知识
Two Principles
–
–
QSAR is a mathematical relationship between a biological activity of
a molecular system and its geometric and chemical characteristics.
QSAR attempts to find consistent relationship between biological
activity and molecular properties, so that these “rules” can be used to
evaluate the activity of new compounds.
Compounds + biological activity
New compounds with
improved biological activity
Cl
Cl
QSAR Quantitative
Structural-Activity Relationship
–
4D: conformational
3D conformation
ensemble, different
The first application of generated descriptors protonation states
QSAR is attributed to
Hansch (1969) 5D: induced-fit
6D: solvation model
2D-QSAR 3D-QSAR 4D-QSAR +````
Cl
Cl
( )
–
–
–
–
–
lgP
–
–
–
–
–
lg 1/C?
–
2.303 lg
1
lg lg 0.434 (
lg 1/C lg 1/Ki pIC50 lgK
C
QSAR
Since 1990s many crystal structures have been solved, structure-based
drug design method is increasing popular.
-- 3D conformation generated descriptors, indirectly provide the structural
information of the receptor and their interactions.
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