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第一章蛋白质化学 [习题] 一、概念题. 1.肤键: 1分子氨基酸的a-狻基和 1分子氨基酸的a-氨基脱水缩合形成 的酰胺键,即 -CO- H-,氨基酸通过肤键连接成多肤链。 2.肤平面:因肤键具有一定程度的双键性质,参与肤键的6个原子C、H、0、 、Cal、 C位不能自由转动,位于同一平面, 平面就是肤平面。 3.多肤链:氨基酸依次通过肤键相互连接,形成长链,称为多肤链。 4.肤单位:肤单位又称为肤基,是肤键主链上的重复结构。是由参与肤链 形成的氮原子、 碳原子和它们的4个取代成分:叛基氧原子,酰胺氢原子和两个 相邻a-碳原子组成的一个 平面单位。肤链中的酰胺基(-CO- H-)称为肤 基或肤单位。 5.蛋白质一级结构:蛋白质中氨基酸的排列顺序。它排除了除氨基酸a-碳 原子的构型以外 的原子空间排列,同样的也排除了二硫键,所以不等于分子的共 价结构。 6.氨基酸残基:氨基酸缩水合成肤之后,氨基酸基团不全,称之为氨基酸 残基,它是一个 分子的一部分,而不是一个分子。氨基酸的氨基上缺了一个氢, 狻基上缺了一个胫基。 7.蛋白质二级结构:指蛋白质多肤链本身的折叠和盘绕的方式。二级结构 主要有a-螺旋、 {3-折叠、/3-转角、自由卷曲。常见的二级结构有a-螺旋和 {3-折叠。二级结构是通过骨 架上的翍基和酰胺基团之间形成的氢键维持的,氢 键是稳定二级结构的主要作用力。 8.超二级结构:在多肤链内顺序上相互邻近的二级结构常常在空间折叠中 靠近,彼 相互 作用,形成规则的二级结构聚集体。 目前发现的超二级结构有三 种基本形式: a螺旋组 合 (aa);f3折叠组合 (f3f3f3) 和a螺旋 B折叠组合 (/3啦),其中以队心组合最为常见。 它们可直接作为三级结构的 “建筑块”或结 构域的组成单位,是蛋白质构象中二级结构与 三级结构之间的一个层次,故称超 二级结构。 9.亚基:蛋白质最小的共价单位,所以又称亚单位。它由一条肤链组成,也可以通过二硫键 把几条肤链连接起来组成。 10.蛋白质三级结构: 三级结构是在二级结构的基础上进一步盘绕、折叠形 成的。也就是 多肤链中所有原子的空间排布。三级结构主要是靠氨基酸侧链之间 的疏水作用、氢键、范 德华力和静电作用维持的。 11.蛋白质四级结构:指蛋白质的多条多肤链之间相互作用所形成的更为复 杂聚合物的一种 结构形式,主要描述蛋白质亚基空间排列以及亚基之间的连接和 相互作用,不涉及亚基内 部结构。蛋白质亚基之间形成的四级结构主要通过疏水 作用、氢键、范德华力等作用力, 其中最主要的是疏水作用。 12.a-螺旋:多肤链沿长轴方向通过氢键向上盘曲所形成的右手螺旋结构 称为a-螺旋。a- 螺旋结构的主要特征为:心肤链以螺旋状盘卷前进,每圈螺 旋由3.6个氨基酸构成,螺圈 间距 (螺距)为0.54nm;®螺旋结构被规则排布 的氢键所稳定,氢键排布的方式是:每个 氨基酸残基的 -H与其氨基侧相间3 个氨基酸残基的-C=O形成氢键。这样构成由一个氢 键闭合的环,包含13个原 子。 因 , a-螺旋常被准确地表示为3.613螺旋。 13./3-折叠:是蛋白质中常见的二级结构,是由伸展的多肤链组成的。折 叠片的构象是通 过一个肤键的碳基氧和位于同一个肤链或相邻肤链的另一个酰胺 氢之间形成的氢键维持 的。氢键几乎都垂直伸展的肤链,这些肤链可以是平行排 列 (走向都是由 到C方向); 或者是反平行排列 (肤链反向排列)。 14./3-转角:也是多肤链中常见的二级结构,连接蛋白质分子中的二级结 构 (a-螺旋和/3- 折叠),使肤链走向改变的一种非重复多肤区,一般含有2~16个氨基酸残基。含有5个 氨基酸残基以上的转角又常称为环 (loops)。常见的 转角含有4个氨基酸残基,有两种类 型。转角 I 的特点是:第一个氨基酸残基朕 基氧与第四个残基的酰胺氢之间形成氢键;转 角II的第三个残基往往是甘氨酸。 这两种转角中的第二个残基大都是脯氨酸。 15.氨基酸等电点:氨基酸在水溶液中狻基失去氢离子带负电,而氨基得到 氢离子带正电, 由千狻基酸性和氨基的碱性不相同,所以氨基酸往往整体上是带 电的。调节溶液的pH值, 可以改变二者的电离状况,到某一点时狻基所带的负电 荷与氨基所带的正电荷相同,氨基 酸表现为整体不带电,这时的pH值就是氨基 酸等电点 (pH)。-COOH的电离常数为pKa,, - 凡的电离常数为pKa2, 则等 电点的pH值为 (pKa,+pKa2)/2。 16.分子病:蛋白质一级结构改变而引起的疾病,由于遗传原因而造成的蛋 白质分子结构或 合成量的异常所引起。蛋白质分子是由基因编码的,即由脱氧核 糖核

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