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第六章、核酸和蛋白质序列分析

第六章、核酸和蛋白质序列分析

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第六章、核酸和蛋白质序列分析

第一节、核酸序列分析

三、DNA序列分析基础

四、DNA序列分析方法

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第六章、核酸和蛋白质序列分析

三、DNA序列分析基础

1、DNA序列分析内容

DNA序列分析

——基因序列

——基因表达调控信

寻找基因牵涉到两个方面的工作:

•识别与基因相关的特殊序列信息

•预测基因的编码区域

•结合两个方面的结果确定基因的位置和结构

基因表达调控信息隐藏在基因的上游区域,在组

成上具有一定的特征,可以通过序列分析识别这

些特征。

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第六章、核酸和蛋白质序列分析

2、DNA序列功能位点

–在DNA序列中,除了基因之外,还包含许多其

它信息,这些信息大部分与核酸的结构特征相关

联,通常决定了DNA与蛋白质或者DNA与RNA

的相互作用。

–存放这些信息的DNA片段称为功能位点,如启

动子(Promoter)、基因终止序列(

Terminatorsequence)、剪切位点(Splice

site)等。

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第六章、核酸和蛋白质序列分析

•功能位点(functionalsite)

-与特定功能相关的位点,是生物分子序列上的一个功能

单元,或者是生物分子序列上一个较短的片段。

•功能位点又称为功能序列(functional

sequence)、序列模式(motif)、信号(signal)

等。

•核酸序列中的功能位点包括转录因子结合位点、

转录剪切位点、翻译起始位点等。

•在蛋白质序列分析中,常使用序列模式这个名词,

蛋白质的序列模式往往与蛋白质结构域或者作用

部位有关。

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第六章、核酸和蛋白质序列分析

DNA序列功能位点示意图

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第六章、核酸和蛋白质序列分析

•基因组序列中若干个相邻的功能位点组

合形成功能区域(functionalregion)。

•功能位点分析的任务

-发现功能位点特征

-识别功能位点

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