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SDS常见问题常见问题
1.配胶缓冲液系统对电泳的影响?
在SDS-PAGE不连续电泳中,制胶缓冲液使用的是Tris-HCL缓冲系统,浓缩胶
是pH6.7,分离胶pH8.9;而电泳缓冲液使用的Tris-甘氨酸缓冲系统。在浓缩胶中,其pH
环境呈弱酸性,因此甘氨酸解离很少,其在电场的作用下,泳动效率低;而CL离子却很高,
两者之间形成导电性较低的区带,蛋白分子就介于二者之间泳动。由于导电性与电场强度成
反比,这一区带便形成了较高的电压剃度,压着蛋白质分子聚集到一起,浓缩为一狭窄的区
带。当样品进入分离胶后,由于胶中pH的增加,呈碱性,甘氨酸大量解离,泳动速率增加,
直接紧随氯离子之后,同时由于分离胶孔径的缩小,在电场的作用下,蛋白分子根据其固有
的带电性和分子大小进行分离。
所以,pHpH对整个反应体系的影响是至关重要的,对整个反应体系的影响是至关重要的,实验中在排除其他因素之后仍
不能很好解决问题的情况,应首要考虑该因素。
2.样品如何处理?
根据样品分离目的不同,主要有三种处理方法:还原SDS处理、非还原SDS处理、
带有烷基化作用的还原SDS处理。
1)还原SDS处理:在上样bufferbuffer中加入SDS和DTT(或BetaBeta巯基乙醇)后,
蛋白质构象被解离,电荷被中和,形成SDS与蛋白相结合的分子,在电泳中,只根据分子量
来分离。一般电泳均按这种方式处理,样品稀释适当浓度,加入上样来分离。一般电泳均按这种方式处理,样品稀释适当浓度,加入上样BufferBuffer,离心,沸水,离心,沸水
煮5min,再离心加样。
2)带有烷基化作用的还原SDS处理:碘乙酸胺的烷基化作用可以很好的并经久
牢固的保护SH基团,得到较窄的谱带;另碘乙酸胺可捕集过量的DTT,而防止银染时的纹
理现象。100ul样品缓冲液中10ul20%的碘乙酸胺,并在室温保温30min。
3)非还原SDS处理:生理体液、血清、尿素等样品,一般只用1%SDS沸水中煮
3min,未加还原剂,因而蛋白折叠未被破坏,不可作为测定分子量来使用。
3.SDS电泳凝胶中各主要成分的作用?
聚丙烯酰胺的作用:丙烯酰胺与为蛋白质电泳提供载体,其凝固的好坏直接关系
到电泳成功与否,与促凝剂及环境密切相关;
制胶缓冲液:浓缩胶选择pH6.7,分离胶选择pH8.9,选择tris-HCL系统,TEMED
与AP:AP提供自由基,TEMED是催化剂,催化自由基引起的聚合反应进行;十二烷基硫酸
钠(SDS):阳离子去污剂,作用有四:去蛋白质电荷、解离蛋白质之间的氢键、取消蛋白
分子内的疏水作用、去多肽折叠。
4.提高SDS电泳分辨率的途径?
聚丙烯酰胺的充分聚合,可提高凝胶的分辨率。建议做法:建议做法:待凝胶在室温凝固后,
可在室温下放置一段时间使用。忌即配即用或4度冰箱放置,前者易导致凝固不充分,后者
可导致SDS结晶。一般凝胶可在室温下保存4天,SDS可水解聚丙烯酰胺。
一般常用的有氨基黑、考马斯亮蓝、银染色三种染料,不同染料又各自不同的染
色方法,具体可参照郭尧君编著的《蛋白质电泳技术手册》P82-103。
5.“微笑”(两边翘起中间凹下)形带原因?
主要是由于凝胶的中间部分凝固不均匀所致,多出现于较厚的凝胶中。
处理办法:待其充分凝固再作后续实验。
6.“皱眉”(两边向下中间鼓起)形带原因?
主要出现在蛋白质垂直电泳槽中,一般是两板之间的底部间隙气泡未排除干净。
处理办法:可在两板间加入适量缓冲液,以排除气泡。
7.为什么带出现拖尾现象?
主要是样品融解效果不佳或分离胶浓度过大引起的。
处理办法:加样前离心;选择适当的样品缓冲液,加适量样品促溶剂;电泳缓冲
液时间过长,重新配制;降低凝胶浓度。
8.为什么带出现纹理现象?
主要是样品不溶性颗粒引起的。
处理办法:加样前离心;加适量样品促溶剂。
9.什么是“鬼带”,如何处理?
“鬼带”就是在跑大分子构象
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