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微生物基因组学;微生物基因组研究概况 微生物基因组的特点 微生物基因组研究的意义;一 微生物基因组研究概况; ;研究现况及内容;二 微生物基因组的特点 ;原核生物基因组的大小 原核生物基因组的编码序列(CDS/ORF) 原核生物染色体结构 GC 含量 重复序列 DNA链组成的非对称性 最小基因组;微生物基因组的特点;1. 原核生物基因组的大小--基因组较小的原核生物;1. 原核生物基因组的大小--基因组较大的原核生物;1. 原核生物基因组的大小--真核生物基因组的大小;2. 原核生物基因组的编码序列(Coding sequence);2. ??核生物基因组的编码序列－－ 不同生物编码序列的比较;基因组编码序列的注释 ;2. 原核生物基因组的编码序列--ORF的注释;2. 原核生物基因组的编码序列－－Distribution of E. coli proteins among 22 functional groups;2. 原核生物基因组的编码序列－－ Distribution of E. coli proteins among 22 functional groups (continued);2. 原核生物基因组的编码序列－－ 原核生物（高温菌）基因组的内含子;3. 原核生物染色体结构;4. GC 含量;4. GC 含量－嗜温菌基因组G + C 含量(%);GC 含量－－ 嗜温菌基因组G + C content (%)(续）;4. GC 含量－－ 嗜热菌最适生长温度（OGT）与G＋C含量的关系;基因组非编码序列的注释;5. 重复序列;5. 重复序列－Repeats in T. maritima genome;5. 重复序列－腾冲嗜热厌氧菌基因组的部分重复序列;5. 重复序列－腾冲嗜热厌氧菌基因组的部分重复序列（续）;重复序列－ Number of repeats by type in N. meningitidis Z2491;重复序列－ Largest families of paralogous genes;6. DNA链组成的非对称性－ GC分布不对称 （GC skew） AT分布不对称（AT skew）;6. DNA链组成的非对称性（真细菌）－ 基因方向性偏好;6. DNA链组成的非对称性（真细菌）－ GC skew， AT skew ， gene orientation bias ;GC skewd of T. tengcongensis genome;微生物基因组的特点;Circular representation of the genome of T. tengcongensis MB4;6. DNA链组成的非对称性－ 密码子使用偏好（codon usage bias）;6. DNA链组成的非对称性－ 原核生物基因组先导链和后随链密码组成的差异 ;6. DNA链组成的非对称性－ 基因密度和密码子使用的差别 ;微生物测序及分析流程图;数据分析软件;Finishing阶段;Blastn 或Blastp参照序列;Finishing阶段;Finishing阶段;Finishing阶段;副血链球菌FW213基因组基本特征 ;副血链球菌FW213基因组基本特征;副血链球菌比对结果;COG分类;代谢途径;代谢途径;比较基因组分析;比较基因组分析;比较基因组分析;进化分析;毒力基因;基因组小岛（fwislet1）;基因组岛(fwisland);抗药性;二元信号转导系统;三 微生物基因组研究的意义基因组研究在医学的应用  基因组研究的生物技术应用  微生物的进化 ;A 基因组研究在医学的应用 ;1. 致病相关基因的鉴定－ 通过基因组比较鉴定病原相关基因;1. 致病相关基因的鉴定－ 致病相关基因的预测;1. 致病相关基因的鉴定－ 致病相关基因的预测（续）;2. 设计特异的实验诊断方法;3. 疫苗的研究;4. 新型抗生素的开发 ;毒力基因作为靶位;必需基因作为药靶;菌种专一基因作为药靶;独特酶类作为药靶;膜转运蛋白作为靶位;新型抗生素的开发;新型抗生素的