RNA的合成讲义-生物化学与分子生物学.docxVIP

RNA的合成讲义-生物化学与分子生物学.docx

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RNA的合成

1.掌握转录的概念;参与转录所需物质及其功能;原核生物和真核生物RNA聚合酶的种类、组成及功能;真核生物mRNA的转录后加工。

2.熟悉转录的过程。

3.了解tRNA和rRNA的转录后加工。

生物体以DNA为模板,在RNA聚合酶的催化作用下以5′-三磷酸核苷酸为原料合成与模板互补的RNA,这个过程称为转录(transctiption),细胞内的各类RNA都是通过转录生成的,信使RNA(messengerRNA,mRNA)是蛋白质合成的直接模板,DNA分子上的遗传信息是决定蛋白质氨基酸序列的原始模板,转录实际上就是把DNA的碱基序列转抄成RNA的碱基序列,通过RNA的合成,遗传信息从染色体的储存状态转送至细胞质,从功能上衔接DNA和蛋白质这两种生物大分子。

转录产物除编码mRNA、tRNA和rRNA外,在真核细胞还有核仁小RNA(smallnucleolar,snoRNA)、核小RNA(smallnuclearRNA,snRNA)、微RNA(microRNA,miRNA)、干扰小RNA(smallinterferingRNA,siRNA)等非编码RNA,这些非编码RNA是保障遗传信息传递的关键因子,有些在基因表达调控过程中表现出重要的生物学功能。经转录生成的各类RNA(原核mRNA除外)还需加工才能成为具有生物学功能的成熟的RNA。

此外,某些RNA病毒是通过RNA复制的方式合成RNA,在宿主细胞内以病毒的单链RNA为模板合成RNA,如SARS病毒、乙型肝炎病毒、禽流感病毒(H5N1、H7N9等)等。

第一节原核生物转录的模板和酶

RNA的合成属于酶促反应,转录反应体系中包括DNA模板、4种三磷酸核苷酸(ATP、GTP、CTP、UTP)、DNA依赖的RNA聚合酶(RNA-dependentRNApolymerase,RNA-pol)、某些蛋白质因子及必要的无机离子如Mg2+等。合成方向为5′→3′,核苷酸间的连接方式为3′,5′-磷酸二酯键。

一、原核生物转录的模板

在遗传信息传递的过程中,生物体为保留全部的遗传信息,DNA基因组全部进行复制;但是转录却不同,只有少部分基因按细胞的不同发育时期、生理需要和生存环境进行转录。通常将能编码RNA或蛋白质的编码基因称为结构基因,在结构基因的DNA双链上,一股链作为模板,按碱基互补规律指导转录生成RNA,这股转录时作为RNA合成模板的单链称为模板链(templatestrand),相对应的另一股单链称为编码链(codingstrand)。转录产物若是mRNA,则可用作翻译的模板,决定蛋白质的氨基酸序列,模板链既与编码链互补,又与mRNA互补,可见mRNA的碱基序列除用U代替T外,与编码链是一致的。文献刊出的各个基因的碱基序列,为避免烦琐和便于查对遗传密码子,一般只写出编码链。在原核生物,一个包含多基因的DNA双链分子中,一个基因只有一股链可转录生成其编码产物,各个基因的模板链并不总在同一条链上,在某个基因节段以其中某一条链为模板进行转录,而在另一个基因节段上可能是以与其对应的单链为模板。

二、原核生物的RNA聚合酶

RNA-pol催化RNA的合成反应,该反应以DNA为模板,以4种三磷酸核苷酸(ATP、GTP、CTP、UTP)为基本原料,还需要Mg2+的参与。RNA合成的化学机制与DNA的复制合成相似,RNA聚合酶催化RNA的合成反应可以表示为:(NMP)n+NTP→(NMP)n+1+PPi,RNA-pol和双链DNA结合时活性最高,以其中一股链为模板,新加入的核苷酸以Watson-Crick碱基配对原则和模板的碱基互补。注意在转录过程中与模板DNA链中A配对的是U而不是T。RNA-pol能够在转录起点处直接启动转录,催化两个核苷酸之间生成磷酸二酯键,因而转录不需要引物。

原核生物中的RNA聚合酶在组成、分子量及功能上极其相似。大肠杆菌(E.coli)的RNA-pol是目前研究得比较透彻的分子,它是由5种亚基(α、β、β′、ω、σ)组成的六聚体(α2ββ′ωσ),分子量达450000,各亚基的功能见表14-1。

表14-1大肠杆菌的RNA聚合酶

核心酶(coreenzyme)由α2ββ′ω亚基组成,σ亚基(又称σ因子,sigmafactor)加上核心酶称为RNA聚合酶全酶。σ亚基能辨认DNA模板上的转录起始部位(启动子),在转录起始时需要RNA聚合酶全酶,转录延长阶段则仅需要核心酶。E.coli中含有多种σ因子,能够识别不同基因的启动子,从而使RNA聚合酶能特异地启动不同基因的转录。

抗结核药物利福平可以特异性抑制原核生物的RNA-pol,它特异性地结合RNA聚合酶的β亚基,从而影响核糖核酸的合成和蛋白质的代谢,导致细菌生长繁殖停止而达到杀菌

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